न्यू मैक्सिको संयुक्त राज्य अमेरिका में चिली काली मिर्च (शिमला मिर्च एसपीपी) के सबसे बड़े उत्पादकों में से एक है, 51,000 में 2021 टन उत्पादन के साथ 8500 एकड़ के क्षेत्र से 6 टन / एकड़ की औसत उत्पादकता के साथ अमेरिकी कृषि विभाग के अनुसार राष्ट्रीय कृषि सांख्यिकी सेवा। औसत उत्पादकता में 25% की कमी आई क्योंकि काली मिर्च के उत्पादन के लिए लगाए गए क्षेत्र समान रहे। इसके परिणामस्वरूप पिछले वर्ष की तुलना में 10 में आर्थिक गतिविधियों में लगभग 2020% की कमी आई, जो $50.1 मिलियन से $44.9 मिलियन हो गई। राज्य में काली मिर्च के कुल उत्पादन में इस महत्वपूर्ण गिरावट ने वैज्ञानिकों को नए आधुनिकीकरण के प्रयासों के लिए प्रेरित किया, जिसका उद्देश्य उच्च-उपज का उपयोग करके उपज और उपज क्षमता से संबंधित विभिन्न लक्षणों का मूल्यांकन करके NMSU चिली काली मिर्च प्रजनन और आनुवंशिकी कार्यक्रम में आनुवंशिक लाभ में तेजी लाने और उत्पादकता में सुधार करना था। टोमैटो एनालाइजर (टीए) जैसे थ्रूपुट फेनोटाइपिंग टूल।
फलों की संरचना और आकृति विज्ञान से संबंधित लक्षण फल विविधता के निर्धारकों में से हैं और काली मिर्च की उपज और उपज के लिए प्रमुख योगदानकर्ता हैं। टीए सॉफ्टवेयर का उपयोग करते हुए, वैज्ञानिकों ने न्यू मैक्सिको की बढ़ती परिस्थितियों के तहत मूल्यांकन किए गए विविध मिर्च मिर्च लाइनों के संग्रह में फल परिधि, आकार सूचकांक, आकार और विषमता सहित फल विशेषताओं के एक सेट पर डेटा एकत्र किया।
शोधकर्ताओं ने एक शिमला मिर्च विविधता पैनल के 105 जीनोटाइप्स को चिह्नित करने का लक्ष्य रखा है, जिसमें कल्टीवार्स, ब्रीडिंग लाइन्स, लैंड्रेस और शामिल हैं। जंगली प्रजाति 12 मॉर्फोमेट्रिक टीए डिस्क्रिप्टर के लिए 32 अलग-अलग पॉड (फल) प्रकार से संबंधित हैं। पदानुक्रमित क्लस्टर विश्लेषण ने टीए विवरणकों के आधार पर जीनोटाइप को आठ समूहों में बांटा। मूल माप-अर्थात्, परिधि, क्षेत्रफल, चौड़ाई मध्य ऊँचाई, अधिकतम चौड़ाई, ऊँचाई मध्यचौड़ाई, ज्यादा से ज्यादा ऊंचाई, और घुमावदार ऊँचाई- समग्र फलों के आकार में अधिकतम योगदान के साथ सबसे अधिक विभेदक वर्णनकर्ता थे।
मॉर्फोमेट्रिक टीए डिस्क्रिप्टर की उपयोगिता, जो पारंपरिक फेनोटाइपिंग के माध्यम से मापना मुश्किल है, का प्रदर्शन किया गया। चिली काली मिर्च प्रजनन कार्यक्रमों में उपज में सुधार के लिए संकरण के लिए पैतृक लाइनों के रूप में क्लस्टर विश्लेषण के आधार पर वांछित फल आकार और आकृति विज्ञान के साथ कई किस्मों की सिफारिश की गई थी। फलों से संबंधित लक्षणों को मापने के लिए टीए का उपयोग करने वाले परिणाम एक आधार प्रदान करेंगे जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन और न्यू मैक्सिकन चिली पेपर में उपज और उपज-योगदान करने वाले लक्षणों के लिए जीनोमिक चयन।